代名詞itの中身をしっかり把握

映画「ブラックセイルズ」シーズン3の第4話です（PotPlayerで日本語と英語の字幕を同時表示）。

ロジャーズは、ナッソーという町の再建のためエレノアを助言者（側近）として指定しました。詳しくは、映画をご覧ください。

ロジャーズ（男）：
Then may I ask what it is that’s causing you to make that face?
なぜ浮かない顔を？

エレノア：
My appointment as your advisor.
補佐になって気が重い。

エレノア：
I understand that you don’t care
部下の反応は気にしないそうだけど、

エレノア：
what reaction your people may have to it,

ここのitは、上から2番目の場面のMy appointment as your advisor.を指しています。少し遠いので、忘れそうです。

エレノア：
but your people, I’m afraid, are only half the issue.　
問題は彼らだけじゃない。

エレノアが言いたいのは、「ロジャーズがエレノアを補佐にし、その結果、気が重い」ということです。

どうして気が重いかというと、「あなたは気にしないだろうが、部下は（私が補佐になったことを）よく思っていない」からです。これが補佐になったことに関連する問題の一つ（half the issue）です。

エレノア：
I have enemies on that island.
島には私の敵がいる。（島＝ニュープロビデンス島）

補佐になったことに関連するもう一つの問題が、「島に敵がいる」ことです。

以上