So were you. ＝君もそうだった。

「ホームランド」、シーズン4、ディスク1の画面です。

前にも書きましたが、「So＋be/do＋主語」の勘違いが非常に多いようです。もちろん、意味は「主語もそうだ／そうする」です。間違いが多いのは、「So＋主語＋be/do」と形が似ているのが原因かもしれません。

それにしても、上の「君は平気そうだな」は、どこから来たのか不明です。おそらく、キャリーが元気いっぱいなせいでしょう。

So were you. ＝ You were right in the middle of it, too.ですので、「（キャリー）、君も現場の最中にいたろう（→疲れているはずだ）」が正しい解釈です。前後の文脈は、映画を見てください。